El 25 de mayo, Mario Romero y Laurianne Despeghel presentaron en este espacio una estimación del exceso de mortalidad para 2020 en la Ciudad de México. Para realizarla, los autores utilizaron una búsqueda binaria de actas de defunción en el sitio del Registro Civil de la Ciudad de México. Después de leer sobre el ingenioso método y consultar el sitio del Registro Civil, decidimos extender su estudio analizando las causas de defunción asentadas en alrededor del 97 %1 de las actas de defunción emitidas en la Ciudad de México durante los meses de abril y mayo, los de mayor actividad de la pandemia hasta ahora.
Estos datos nos permitieron encontrar respuestas a las siguientes preguntas: ¿Cuántas actas de defunción mencionan COVID-19 en la Ciudad de México durante abril y mayo? ¿Qué otras causas de muerte registradas en las actas de defunción podrían tener un vínculo con COVID-19? Y, ¿cómo luce la curva epidémica si se crea utilizando la información de las actas de defunción?
Encontramos que 7 198 actas de defunción emitidas durante abril y mayo en la Ciudad de México mencionan2 “COVID-19” entre las causas de muerte, confirmando una brecha entre los números reportados a nivel federal y lo registrado en las actas de defunción de la ciudad. Nuestro análisis muestra que una de cada cinco actas que mencionan “neumonía atípica" no mencionan "COVID-19" como causa, y una de cada 10 que menciona "neumonía viral" tampoco lo hace. Finalmente, observamos un máximo en la curva de defunciones de la Ciudad de México alrededor del 18 de mayo.
Ilustración: Gonzalo Tassier
Datos
Comenzamos por extraer los datos relevantes del sitio del Registro Civil de la Ciudad de México. Para hacerlo, primero definimos los folios de las actas a consultar. Decidimos analizar los datos de las actas de defunción de abril y mayo3 registradas en los juzgados4 que han permanecido abiertos durante la pandemia. Estas actas de defunción suman alrededor del 97 % del total de la ciudad en estos dos meses, de acuerdo a las estimaciones de Romero y Despeghel. Para obtener los folios correspondientes a esas actas usamos la búsqueda binaria descrita en su texto.5 Para el juzgado 51, que emitió 32 % de las actas, incluímos los folios correspondientes a todo 2020 para poder realizar un análisis más extenso.
Una vez que los folios fueron determinados, realizamos una consulta secuencial de las actas de defunción correspondientes. El 26 de mayo, apenas un día después de la publicación de Un folio, un deceso, el sitio del Registro Civil usado por Romero y Despeghel fue modificado. Ahora requiere de un CAPTCHA (Completely Automated Public Turing test to tell Computers and Humans Apart) para la validación de cada consulta. Esta prueba hace imposible la recolección de datos sin interacción humana. Para cumplir con las nuevas reglas y poder obtener los datos necesarios para este este trabajo, utilizamos un servicio de crowdworkers (personas que ejecutan remotamente simples tareas repetitivas), quienes resolvieron el CAPTCHA correspondiente a la consulta de cada acta. Una vez resuelto el CAPTCHA, el programa que escribimos realizaba la solicitud correspondiente y almacenaba la fecha de defunción y las causas de muerte de cada acta. Este proceso es completamente análogo a visitar cada una de las actas manualmente y recolectar estos campos. Nuestro método simplemente permite acelerar una tarea repetitiva en un sitio abierto al público utilizando crowdworkers. Con el fin de evitar cualquier saturación en el sistema, nuestro método realizó una solicitud cada cinco segundos. Es necesario resaltar que el interés de este ejercicio es sólo respecto a las causas de defunción, por lo que no se recolectaron ni analizaron datos personales de las actas de defunción.
A partir de este procedimiento construimos una base de datos que incluye las causas de muerte registradas en 20 900 actas de defunción emitidas por los juzgados 13, 14, 16, 18, 19 y 51 del Registro Público de la Ciudad de México en abril (8 672 actas) y mayo (12 228 actas) de 2020. La siguiente gráfica ilustra el número de actas por juzgado y mes.
Resultados
Como se ha descrito en otros espacios, las causas de muerte registradas en las actas de defunción pueden ser expresadas de diversas maneras. Por ejemplo, los términos Coronavirus, COVID, COVID19 o SARS-COV2 se refieren todos a una misma causa de muerte. Por ello creamos una taxonomía que nos permitió agrupar los diferentes términos utilizados en las diversas actas en un número limitado de categorías. La taxonomía puede ser consultada aquí. Los datos extraídos, anonimizados y clasificados según la taxonomía pueden ser consultados acá. Cabe mencionar que en algunas actas la causa registrada es posible COVID, en otras es simplemente COVID y en una mínima cantidad COVID confirmado. Para los fines de este análisis, todas ellas fueron agrupadas en la categoría COVID-19.
La gráfica anterior muestra que en 7 198 de las 20 900 actas de defunción emitidas en abril y mayo de este año en la Ciudad de México (34 % del total) la causa de muerte correspondía a alguno de los términos incluidos en la categoría COVID-19. Este número contrasta con los 2 1396 fallecimientos reportados por la Dirección General de Epidemiología de la secretaría de Salud para la Ciudad de México durante el mismo período.
La gráfica también muestra que otras causas relacionadas al COVID-19, tales como insuficiencia respiratoria, neumonía atípica y neumonía viral aparecieron en un número significativo de actas.
Una misma acta de defunción puede mencionar varias causas de muerte de manera simultánea. La gráfica a continuación presenta la frecuencia de coocurrencia de las cuatro grandes categorías de causas de muerte utilizadas en este análisis. Por ejemplo, 2 893 actas de defunción (primera barra de izquierda a derecha) mencionan de manera simultánea alguna de las causas incluidas en las categorías de “neumonía atípica”,“insuficiencia respiratoria” y “COVID-19” pero no mencionan “neumonía viral”.
En total, 4 041 actas mencionan de manera simultánea alguna de las causas de muerte agrupadas en las categorías de “COVID-19”7 y “neumonía atípica” (sólas o acompañadas de otras causas). Sin embargo, una de cada cinco actas (786) que menciona alguna de las causas agrupadas en “neumonía atípica”, no menciona alguna de las agrupadas en la categoría de “COVID-19”.8 La misma lógica es aplicable a una de cada diez actas (63) en las que las causas de defunción solo incluyen “neumonía viral”.
Tomando en cuenta lo anterior, decidimos calcular el número total de actas en donde se mencionan “COVID-19” y una combinación más amplia de causas (“COVID-19”, o neumonía atípica, o neumonía viral) los dos meses de analizados. En abril, el 23 % (1 980) de las actas mencionan a “COVID-19”. Para mayo, esta cifra casi se duplica, convirtiéndose en el 42 % (5 218). El acumulado de decesos que mencionan “COVID-19” como causa durante estos dos meses es de 7 198. Cuando agregamos a la cuenta los casos en los que “neumonía atípica” o “neumonía viral” son mencionados, esta cifra se eleva a 8 039 (o 38 %).
Al contrastar el número de actas que mencionan alguna causa contenida en las categorías “COVID-19”, “neumonía atípica”o “neumonía viral” (2 269 para abril y 5 770 para mayo) con el exceso de mortalidad calculado por Romero y Despeghel para esos meses (2 429 para abril y 7 395 para mayo), encontramos que nuestra cifra para mayo difiere significativamente. El dato que nosotros reportamos fue calculado usando las actas de defunción hasta el 25 de mayo, mientras que el exceso de mortalidad reportado por Romero y Despeghel considera el mes completo. Suponiendo que la última semana del mes de mayo se comporta como el promedio de las primeras tres, estimamos que nuestra cifra llegaría a 7 154 defunciones para el mes completo —en línea con el resultado encontrado anteriormente.
¿Cómo se comparan estos datos con las cifras oficiales para la Ciudad de México? Si consideramos el número acumulado de actas de defunción emitidas entre el 1 de abril y el 25 de mayo y que mencionan COVID-19 como una de las causas de fallecimiento (línea naranja en el panel superior en la gráfica de arriba), la cifra (7 198) es tres veces mayor al número de fallecimientos confirmados registrados por la Dirección General de Epidemiología en el mismo periodo para esta entidad. De forma similar, la curva de fallecimientos diarios es sustantivamente más alta que la que se reporta de manera oficial (línea naranja en el panel inferior en la gráfica de arriba), con un máximo el 18 de mayo. La serie de tiempo de casos diarios puede ser consultada aquí.
Este análisis confirma la discrepancia que en este momento existe entre los datos reportados de manera oficial y los datos en las actas de defunción emitidas por los juzgados de la Ciudad de México. Esta discrepancia fue anticipada explícitamente por las autoridades federales. Nuestro interés es ofrecer información preliminar que permita cuantificar la magnitud de esta brecha, así como hacer notar la importancia de contar con datos abiertos para poder comprender la verdadera magnitud del fenómeno de COVID-19 en la Ciudad de México. Entre mejor estemos informados los ciudadanos, mejores decisiones podremos tomar para protegernos a nosotros mismos y a los demás. En este momento, la mejor política de salud pública es la transparencia.
Sarahí Aguilar
Científica de datos.
Moisés Arizpe
Científico de datos.
1 Calculado con base en las estimaciones de Romero y Despeghel consultables aquí.
2 Como será descrito más adelante utilizamos una taxonomía para etiquetar las causas de muerte. La taxonomía se puede consultar aquí.
3 Con fecha máxima del 25 de mayo del 2020.
4 Los juzgados analizados fueron el 13, 14, 16, 18 y 51.
5 Los números de acta consultados fueron para el juzgado 13 del 498 al 3 018; para el 14 del 8 350 al 16 075; para el 16 del 239 al 769; para el 18 del 4 888 al 8 658; para el 51 del 1 al 10 467.
6 Al 25 de mayo consultado 2 de junio a las 22:00 horas.
7 La suma de las intersecciones exclusivas COVID-19 ∩ neumonía atípica, insuficiencia respiratoria ∩ COVID 19 ∩ neumonía atípica, insuficiencia respiratoria ∩ COVID 19 ∩ neumonía viral y COVID-19 ∩ insuficiencia respiratoria ∩ neumonía atípica ∩ neumonía viral. Para más información sobre la visualización se puede consultar este artículo.
8 Dado que en los meses anteriores a la pandemia la presencia de “neumonía atípica” era prácticamente nula, es posible suponer que estas defunciones estén vinculadas a COVID-19. Para analizar esta posibilidad, extendimos el análisis de las actas del Juzgado 51 (mismo que concentra alrededor del 32 % del total de las actas de defunción en la Ciudad de México durante los últimos dos meses) para abarcar el período febrero-mayo. Como resultado de este ejercicio, observamos que en febrero y marzo se registró un número mínimo de actas de defunción que mencionaron neumonía atípica (11 casos) y neumonía viral (1 caso) entre las causas de muerte.
¡ Caray ! un trabajo vigente, reflexivo, de analítica investigación y notable conocimiento técnico.
Felicito a los autores.
Excelente su trabajo, gracias. ¿Habría alguna forma de obtener los datos de la base de datos del Registro Civil para Ciudad Juárez? Médicos del Hospital Covid del IMSS estuvieron reportando cantidades de muertes muy superiores a las reportadas oficialmente, y nos interesaría poder realizar el análisis.
Excelente análisis. Le criticaría que no intenta cuantficar el sobrediagnóstico. No sabemos la magnitud de ese error, que se podría estimar en forma semejante a lo que publicaron Zavala y Despeghel, si se obtiene el dato de muertes por neumonía atípica en años anteriores. Por otra parte, me parecería que la magnitud del error que reportan es semejante a la que ha visto reportada de otros países en medios diversos; con fines de evitar el sensacionalismo, sería útil hacer un comparativo con datos publicados al respecto. Pero los felicito por un gran trabajo.
Me parece una investigación bastante exhaustiva y analítica. Sin embargo, no considero preciso que hayan considerado en su análisis a las actas de defunción con causa registrada como (posible COVID) dentro de la categoría (COVID-19). Están considerando a las actas registradas con causa de muerte como (posible COVID) como actas con causa de muerte por (COVID-19). La causa registrada como (posible COVID) indica que no se tuvo 100% la certeza de confirmación de muerte por COVID-19. Por lo tanto, en un estudio científico se debe de ser bastante objetivo y no se debe suponer un hecho que no fue confirmado en su totalidad y agruparlo junto con otros datos que sí fueron especificados o confirmados. Independientemente de esto, felicito a los autores por el gran trabajo y fervor mostrado. ¡Mis sinceras felicitaciones!
Felicidades cómo ayudar para lograr que los datos que explotan fueran abiertos máxima transparencia
Felicidades a los realizadores de esta magna investigación, es de destacar que es un trabajo realizado con una Metodología Científica y los responsables muestran un estudio sin tintes políticos, digno de una labor magistralmente profesional.
Según su estudio, por qué cantidad habría que multiplicar las cantidades oficiales publicadas por el gobierno.
Y una duda, cuántos decesos en promedio sucedieron en el año 2019 por mes en la Cd de Mexico y cuantos se debieron a enfermedades respiratorias
Excelente trabajo de investigación periodística. A los médicos nos va a ser muy útil esta información. Muestra un comportamiento más real de la pandemia que el observado en los datos de Lopez-Gatell.
Gracias.
Interesante análisis de datos, felicidades! Según su información, es preocupante el mayor número de muertes causadas por COVID. Sin embargo, un aspecto positivo que se aprecia en la gráfica de «Fallecimientos diarios» es la tendencia de decrecimiento del número de muertes diarias que se da a partir del pico del 18 de mayo, Si bien habrá que esperar a que en el mes de junio se confirme esta tendencia en la Ciudad de México.
Saludos cordiales
Las actas de defunción son un documento oficial, pero me queda la duda si se registra como causa de muerte Covid el resultado esta amparado por una prueba diagnóstica, una autopsia o algún método que determine la causa. Creo que aquí hay tela de donde cortar dado que dudo de la capacidad de los MP o médicos legistas que avalan las actas de defunción.
Saludos y felicitaciones por el trabajo que realizaron.
La discrepancia que encontraron, es la diferencia entre una sospecha de COVID19 anotada en un acta y una causa confirmada COVID19 sustentada por una prueba molecular. Una reflexión importante sería; ¿por que México tiene una capacidad limitada para realizar pruebas de SARS-Cov2? y no me refiero a las pruebas rápidas de anticuerpos.